Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD247P20963 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD247P20963 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD247P20963 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms