Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF3P18847 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF3P18847 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms