Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCZQ96LD1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCZQ96LD1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCZQ96LD1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCZQ96LD1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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