Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms