Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1Q5T2W1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms