Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBB4BP68371 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms