Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms