Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms