Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CAPGP40121 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms