Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V9GYV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V9GYV3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V9GYV3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V9GYV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V9GYV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V9GYV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V9GYV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
V9GYV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
V9GYV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V9GYV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
V9GYV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V9GYV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
V9GYV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V9GYV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms