Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD54BQ9Y620 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD54BQ9Y620 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms