Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFR3BQ9Y2G0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3BQ9Y2G0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms