Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
TRAK1Q9UPV9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRAK1Q9UPV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms