Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSFL1CQ9UNZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NSFL1CQ9UNZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NSFL1CQ9UNZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms