Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1RE1Q9UN81 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms