Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PADI1Q9ULC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PADI1Q9ULC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI1Q9ULC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms