Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CFAP45Q9UL16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP45Q9UL16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP45Q9UL16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms