Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3Q9UKS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3Q9UKS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms