Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RCAN3Q9UKA8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RCAN3Q9UKA8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RCAN3Q9UKA8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RCAN3Q9UKA8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RCAN3Q9UKA8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RCAN3Q9UKA8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms