Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf18Q9UK00 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf18Q9UK00 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms