Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL3Q9UH77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL3Q9UH77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms