Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNN3Q9UGI6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNN3Q9UGI6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNN3Q9UGI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms