Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT3BQ9UBC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNMT3BQ9UBC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms