Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPSF2Q9P2I0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPSF2Q9P2I0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms