Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP36Q9P275 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP36Q9P275 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms