Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CXXC1Q9P0U4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXXC1Q9P0U4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms