Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CWC15Q9P013 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC15Q9P013 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms