Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDND1Q9NY35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDND1Q9NY35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDND1Q9NY35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDND1Q9NY35 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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