Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO28Q9NVF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO28Q9NVF7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO28Q9NVF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO28Q9NVF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 496.8 ms