Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 39
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 239.5■■■■□ 3.911e-6■■■■■ 39
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 328.76■■■□□ 2.21e-6■■■■■ 39
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 39
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 231.94■■■□□ 2.73e-6■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 327.17■■□□□ 1.943e-6■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 324.2■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.098e-8■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.338e-8■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.738e-8■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-9■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.446e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 534.87■■■■□ 3.176e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-211ENST00000585091 739 ntTSL 331.48■■■□□ 2.636e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.276e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 328.84■■■□□ 2.216e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-205ENST00000580090 752 ntTSL 228.55■■■□□ 2.166e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.116e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 326.14■■□□□ 1.786e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 224.84■■□□□ 1.576e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.146e-7■■■■■ 38.9
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 524.32■■□□□ 1.483e-8■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 513.79□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 53.57□□□□□ -1.841e-9■■■■■ 38.8
DROSHAQ9NRR4 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)30.03■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)30.03■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.945e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.895e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 526.36■■□□□ 1.815e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 425.78■■□□□ 1.725e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 225.75■■□□□ 1.715e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 424.83■■□□□ 1.575e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.565e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.095e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 320.67■□□□□ 0.95e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 AC009065.4-202ENST00000567888 274 ntTSL 538.53■■■■□ 3.767e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.457e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 38.7
DROSHAQ9NRR4 FADS1-217ENST00000544309 581 ntTSL 328.31■■■□□ 2.121e-7■■■■■ 38.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 325.47■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 38.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 418.64■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 38.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 38.6
DROSHAQ9NRR4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.079e-7■■■■■ 38.5
DROSHAQ9NRR4 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 417.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 38.5
DROSHAQ9NRR4 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 322.14■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-206ENST00000464750 966 ntTSL 1 (best)39.9■■■■□ 3.981e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.91e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.791e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-207ENST00000463086 505 ntTSL 538.23■■■■□ 3.711e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.571e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.471e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.431e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-209ENST00000480417 777 ntTSL 236.14■■■■□ 3.381e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.191e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.691e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-208ENST00000478319 452 ntTSL 531.71■■■□□ 2.671e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 531.26■■■□□ 2.591e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ESPN-213ENST00000632803 455 ntTSL 331.17■■■□□ 2.581e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.491e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ESPN-212ENST00000632593 506 ntTSL 229.73■■■□□ 2.351e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.341e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SPSB3-210ENST00000568416 520 ntTSL 229.45■■■□□ 2.311e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-214ENST00000494611 474 ntTSL 529.19■■■□□ 2.261e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 MEF2D-205ENST00000475587 1627 ntTSL 529■■■□□ 2.231e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.221e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.191e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 MEF2D-206ENST00000489057 593 ntTSL 528.2■■■□□ 2.11e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 U2AF1-211ENST00000486519 682 ntTSL 325.56■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 325.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 225.26■■□□□ 1.631e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-210ENST00000481355 466 ntTSL 325■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 323.73■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 PHF1-203ENST00000427004 609 ntTSL 423.42■■□□□ 1.347e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-213ENST00000494541 712 ntTSL 321.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ST6GALNAC6-206ENST00000447681 802 ntTSL 220.9■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 PHF1-205ENST00000428274 836 ntTSL 520.18■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 PHF1-206ENST00000459809 461 ntTSL 420.06■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 317.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 38.4
DROSHAQ9NRR4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 38.4
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