RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480417.5

ST6GALNAC6-209, Transcript of ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 6, humanhuman

TSL 2

Gene ST6GALNAC6, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.97■■■■■ 6.87
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.68■■■■■ 5.86
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ABCC9O60706 1549 aa51.29■■■■■ 5.8
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.96■■■■■ 5.43
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.8■■■■■ 5.4
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 NACADO15069 1562 aa48.75■■■■■ 5.39
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.22■■■■■ 5.31
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.89■■■■■ 5.26
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.85■■■■■ 5.25
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.84■■■■■ 5.25
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.62■■■■■ 5.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.57■■■■■ 5.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SCRIBQ14160 1630 aa47.29■■■■■ 5.16
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.86■■■■■ 5.09
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.3■■■■■ 5
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SMARCA4P51532 1647 aa45.11■■■■■ 4.81
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 NCAPD3P42695 1498 aa45.02■■■■■ 4.8
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.02■■■■■ 4.8
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SMARCA2P51531 1590 aa44.87■■■■■ 4.77
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 HMGXB3Q12766 1538 aa44.74■■■■■ 4.75
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.73■■■■■ 4.75
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.6■■■■■ 4.73
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 NESP48681 1621 aa44.24■■■■■ 4.67
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ERCC6Q03468 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 WIZO95785 1651 aa44.21■■■■■ 4.67
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.89■■■■■ 4.62
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CUX2O14529 1486 aa43.86■■■■■ 4.61
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.71■■■■■ 4.59
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.65■■■■■ 4.58
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.62■■■■■ 4.57
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CFTRP13569 1480 aa43.32■■■■■ 4.53
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.24■■■■■ 4.51
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.22■■■■■ 4.51
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.2■■■■■ 4.51
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.19■■■■■ 4.51
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 WDR62O43379 1518 aa43.13■■■■■ 4.5
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 PRDM2Q13029 1718 aa42.85■■■■■ 4.45
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TOPBP1Q92547 1522 aa42.49■■■■■ 4.39
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.35■■■■■ 4.37
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ABCC8Q09428 1581 aa42.33■■■■■ 4.37
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 IFT140Q96RY7 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.98■■■■■ 4.31
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 OSCARQ8IYS5 282 aa41.98■■■■■ 4.31
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.319e-11■■■■■ 42.1
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.93■■■■■ 4.3
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SOGA1O94964 1423 aa41.91■■■■■ 4.3
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TRIM41Q8WV44 630 aa41.68■■■■■ 4.26
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 FBLN2P98095 1184 aa41.59■■■■■ 4.25
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CHD1O14646 1710 aa41.57■■■■■ 4.25
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 WDR97A6NE52 1622 aa41.56■■■■■ 4.24
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.54■■■■■ 4.24
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.44■■■■■ 4.23
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TOP2BQ02880 1626 aa41.41■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.4■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ARHGEF11O15085 1522 aa41.34■■■■■ 4.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.33■■■■■ 4.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 PBRM1Q86U86 1689 aa41.33■■■■■ 4.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SYNJ2O15056 1496 aa41.25■■■■■ 4.19
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.03■■■■■ 4.16
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ADAMTS12P58397 1594 aa41■■■■■ 4.15
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ARAP1Q96P48 1450 aa41■■■■■ 4.15
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 GRIN2AQ12879 1464 aa40.94■■■■■ 4.14
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.91■■■■■ 4.14
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CEP170Q5SW79 1584 aa40.79■■■■■ 4.12
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 NUP160Q12769 1436 aa40.77■■■■■ 4.12
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 KIF27Q86VH2 1401 aa40.65■■■■■ 4.1
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.61■■■■■ 4.09
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 IGF1RP08069 1367 aa40.58■■■■■ 4.09
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 SHROOM2Q13796 1616 aa40.49■■■■■ 4.07
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 CUL7Q14999 1698 aa40.41■■■■■ 4.06
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.41■■■■■ 4.06
ST6GALNAC6-209ENST00000480417 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms