Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2B1Q9NRF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2B1Q9NRF2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SH2B1Q9NRF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2B1Q9NRF2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms