Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9BQ9NQ34 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM9BQ9NQ34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms