Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP13A2Q9NQ11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP13A2Q9NQ11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms