Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC4Q9NPG8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.4 ms