Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFGAP3Q9NP61 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms