Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP3Q9H6T3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPAP3Q9H6T3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms