Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG9Q9H0W8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG9Q9H0W8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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