Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-202ENST00000511341 1582 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 48.28□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 46.14□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-211ENST00000639478 7992 ntTSL 520.39■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-212ENST00000640028 7375 ntTSL 519.19■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-19■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-19■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.553e-19■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.63e-19■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 49.68□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 410.79□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.937e-16■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.791e-8■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 28.1
CSTF2TQ9H0L4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.91e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-205ENST00000464009 478 ntTSL 56.07□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-209ENST00000478930 563 ntTSL 45.6□□□□□ -1.513e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-205ENST00000430295 440 ntTSL 220.45■□□□□ 0.868e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.338e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 48.87□□□□□ -0.998e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.048e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-206ENST00000438202 652 ntTSL 28.25□□□□□ -1.098e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 25.63□□□□□ -1.518e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 34.72□□□□□ -1.658e-10■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 224.12■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-207ENST00000468401 573 ntTSL 412.45□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-213ENST00000497535 702 ntTSL 211.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 HBP1-206ENST00000468116 579 ntTSL 411.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 519.79■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 326.06■■□□□ 1.763e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 225.62■■□□□ 1.693e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 424.33■■□□□ 1.493e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 524.33■■□□□ 1.493e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 49.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 28
CSTF2TQ9H0L4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-214ENST00000622373 2129 nt18.89■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 418.12■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 415.74■□□□□ 0.114e-9■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 515.74■□□□□ 0.114e-9■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 GAK-218ENST00000511983 558 ntTSL 411.24□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 59.1□□□□□ -0.953e-11■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ADORA2A-211ENST00000496258 689 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ADORA2A-212ENST00000496497 691 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 218.62■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CCDC148-204ENST00000417066 1447 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CCDC148-208ENST00000491563 458 ntTSL 515.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 514.82□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CCDC148-206ENST00000451554 1471 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-205ENST00000437030 566 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 510.4□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 CCDC148-203ENST00000409889 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 KPNA1-206ENST00000476916 575 ntTSL 48.81□□□□□ -12e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 48.4□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 KPNA1-209ENST00000493510 596 ntTSL 47.17□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 PI4KA-215ENST00000485963 2301 ntTSL 221.6■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 416.42■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 27.9
CSTF2TQ9H0L4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-208ENST00000422080 578 ntTSL 316.74■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 416.74■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 416.74■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-223ENST00000449864 529 ntTSL 514.85□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-10■■■■■ 27.8
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