Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL4Q9C0H6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL4Q9C0H6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms