Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL9Q9BYD2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL9Q9BYD2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MRPL9Q9BYD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL9Q9BYD2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.7 ms