Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM2Q9BV94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDEM2Q9BV94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDEM2Q9BV94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 946.1 ms