Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 32.1
BUD13Q9BRD0 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 32.1
BUD13Q9BRD0 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 32.1
BUD13Q9BRD0 MRPL55-225ENST00000465268 848 ntTSL 217.39■□□□□ 0.374e-8■■■■■ 32.1
BUD13Q9BRD0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.867e-13■■■■■ 32
BUD13Q9BRD0 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 515.59■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 32
BUD13Q9BRD0 TOE1-203ENST00000471337 1074 ntTSL 316.63■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 31.9
BUD13Q9BRD0 TOE1-205ENST00000495703 2173 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 31.9
BUD13Q9BRD0 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 31.9
BUD13Q9BRD0 TOE1-202ENST00000460057 592 ntTSL 39.32□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 31.9
BUD13Q9BRD0 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 31.9
BUD13Q9BRD0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.633e-7■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 31.8
BUD13Q9BRD0 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 31.8
BUD13Q9BRD0 HSPG2-202ENST00000374676 411 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.127e-9■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-9■■■■■ 31.8
BUD13Q9BRD0 U2AF1L4-204ENST00000585554 1244 ntTSL 213.75□□□□□ -0.217e-9■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 COG1-202ENST00000438720 4051 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 31.8
BUD13Q9BRD0 COG1-209ENST00000582973 438 ntTSL 312.96□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 U2AF1L4-203ENST00000412391 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-9■■■■■ 31.8
BUD13Q9BRD0 U2AF1L4-202ENST00000378975 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.357e-9■■■■■ 31.8
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BUD13Q9BRD0 LAT-207ENST00000562701 816 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 31.7
BUD13Q9BRD0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 31.7
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BUD13Q9BRD0 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-9■■■■■ 31.6
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BUD13Q9BRD0 WDR77-204ENST00000497278 722 ntTSL 38.22□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 31.6
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BUD13Q9BRD0 ATF7IP-204ENST00000534828 550 ntTSL 37.12□□□□□ -1.275e-9■■■■■ 31.6
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BUD13Q9BRD0 CHD2-204ENST00000625463 340 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.486e-17■■■■■ 31.6
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BUD13Q9BRD0 TLE1-201ENST00000376463 1115 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 31.5
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BUD13Q9BRD0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 31.5
BUD13Q9BRD0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 31.5
BUD13Q9BRD0 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 31.5
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BUD13Q9BRD0 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 322.67■■□□□ 1.224e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 222.12■■□□□ 1.134e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.114e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.974e-12■■■■■ 31.4
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