Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMF1Q96S06 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMF1Q96S06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms