Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP4Q96P64 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP4Q96P64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms