Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD6Q96NE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD6Q96NE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms