Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf85Q96MD7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms