Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKNOX2Q96KN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX2Q96KN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX2Q96KN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms