Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHAMP1Q96JM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms