Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEURL3Q96EH8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL3Q96EH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEURL3Q96EH8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms